Dažos gadījumos, biežāk sievietēm, akūts pielonefrīts sākas ar akūtu cistītu (bieža un sāpīga urinēšana, sāpes urīnpūslī, termināla hematūrija). Citi akūta mielonefrīta simptomi: vispārējs nogurums, vājums, muskuļu un galvassāpes, apetītes zudums, slikta dūša, vemšana.