Lupus nefrīts ir tipisks imūnkompleksu nefrīts, kura attīstības mehānisms atspoguļo sistēmiskās sarkanās vilkēdes patoģenēzi kopumā. Sistēmiskās sarkanās vilkēdes gadījumā notiek B šūnu poliklonāla aktivācija, ko var izraisīt gan primārs ģenētisks defekts, gan T limfocītu disfunkcija un CD4+ un CD8+ šūnu attiecības samazināšanās.