Meningokoku infekcijas ārstēšana ir atkarīga no slimības klīniskās formas. Nazofaringīta gadījumā terapija ir simptomātiska. Ja diagnoze tiek apstiprināta bakterioloģiski, 3 dienas vidējās terapeitiskās devās lieto benzilpenicilīnu, ampicilīnu, pirmās un otrās paaudzes cefalosporīnus, hloramfenikolu, pefloksacīnu. Nedrīkst lietot ko-trimoksazolu un aminoglikozīdus, pret kuriem lielākā daļa pašlaik esošo meningokoku celmu ir rezistenti.