EEG analīze tiek veikta ierakstīšanas laikā un visbeidzot pēc tā pabeigšanas. Ierakstīšanas laikā tiek novērtēta artefaktu klātbūtne (tīkla strāvas lauku indukcija, elektrodu kustības mehāniskie artefakti, elektromiogramma, elektrokardiogramma utt.) un veikti pasākumi to novēršanai. Tiek novērtēta EEG frekvence un amplitūda, identificēti raksturīgie grafiskie elementi un noteikts to telpiskais un laika sadalījums.