HCV genomu attēlo vienpavediena pozitīvi lādēta RNS, kas kodē 3 strukturālus (nukleokapsīda proteīna kodols un apvalka E1-E2 nukleoproteīni) un 5 strukturālus (NS1, NS2, NS3, NS4, NS5) proteīnus. Katram no šiem proteīniem tiek sintezēti AT, kas atrodami pacientu ar vīrusu hepatītu C asinīs.