Analīzē atklāti jauni pierādījumi par A grupas streptokoku infekciju skaita pieaugumu pasaulē

A grupas streptokoks (Strep A) ir izplatīts baktēriju veids, kas parasti izraisa rīkles infekcijas un skarlatīnu. Lai gan lielākā daļa infekciju ir vieglas, retos gadījumos Strep A var izraisīt invazīvas infekcijas, kas var būt letālas.

Laikā no 2022. līdz 2023. gadam veselības aprūpes dienesti visā pasaulē reģistrēja smagu invazīvu A streptokoku infekciju pieaugumu pēc pandēmijas ierobežojumu atcelšanas. Jauns Londonas Imperiālās koledžas un Anglijas Sabiedrības veselības aizsardzības zinātnieku pētījums apstiprināja, ka baktērijas variantam ar nosaukumu M1UK bija galvenā loma šajā pieaugumā.

Ir zināms, ka M1 celmi izraisa invazīvākas infekcijas nekā citi A tipa streptokoku tipi. Lai gan šis variants pirmo reizi tika identificēts un sekvencēts Apvienotajā Karalistē, M1UK nesen ir saistīts ar smagu infekciju skaita pieaugumu Eiropā, Austrālijā, Ziemeļamerikā un Japānā pēc pandēmijas ierobežojumu atcelšanas. Tas ir atklāts arī Dienvidamerikā, Jaunzēlandē un Taivānā.

Zemais A tipa streptokoku infekciju līmenis pandēmijas laikā, visticamāk, padarīja iedzīvotājus, īpaši bērnus, īpaši neaizsargātus pret šīm infekcijām, veicinot saslimstības pieaugumu daudzās valstīs.

Jaunā M1UK ģenētikas pētījumā, kas publicēts žurnālā Nature Communications, zinātnieki sniedz jaunus datus par to, kad šis variants pirmo reizi parādījās un kā tas salīdzināms ar citiem celmiem.

M1UK un starppopulāciju globālā izplatība un potenciālie ieviešanas notikumi. A Filoģenētiskais koks ar 2364 M1UK un starpposma celmiem, kas savākti visā pasaulē no 2005. gada marta līdz 2023. gada jūlijam. B Vienkāršots transmisijas koks, kas ģenerēts ar PastML, parādot M1UK līniju un starppopulāciju senču epidēmiskās izcelsmes atrašanās vietu. C Aprēķinātais efektīvais M1UK populācijas lielums (Ne) Apvienotajā Karalistē laika gaitā. Nature Communications (2024). DOI: 10.1038/s41467-024-47929-7

Izmantojot pacientu paraugu ģenētisko sekvencēšanu apvienojumā ar datormodelēšanu, viņi atklāja, ka M1UK, visticamāk, parādījās ap 2008. gadu un sāka pakāpeniski pieaugt no 2010. gada.

Salīdzinot ar agrākajiem M1 celmiem, kas pēdējo 40 gadu laikā ir palikuši relatīvi nemainīgi, M1UK ražo vairāk toksīnu, kas izraisa skarlatīnu.

Profesore Širanī Sriskandana no Londonas Imperiālās koledžas Infekcijas slimību departamenta, kura vadīja pētījumu kopā ar kolēģiem no UKHSA, sacīja: "Baktērijas laika gaitā attīstās, un, tā kā A tipa streptokoks ir tikai cilvēka patogēns, tas iegūst ģenētiskas izmaiņas, izplatoties populācijā. Lielākā daļa variantu laika gaitā parādās un izzūd, taču M1UK tagad šķiet labi iedibināts Apvienotajā Karalistē un citās valstīs. Vai tas tā saglabāsies ilgtermiņā, nav zināms."

Ģenētiskā vēsture

Veicot meklēšanu globālajās genomikas datubāzēs, komanda parādīja, ka, kad M1UK pirmo reizi tika atklāts Apvienotajā Karalistē 2019. gadā, ārpus Apvienotās Karalistes no genoma sekvencēm varēja identificēt tikai divus M1UK celmus. Taču turpmākā analīze no citām valstīm, pētot mainīgās tendences streptokoku A infekcijās (tostarp invazīvās infekcijās), liecina, ka M1UK tagad ir sastopams vairāk nekā 10 valstīs visā pasaulē un dažos gadījumos pēc pandēmijas ir kļuvis par dominējošo celmu.

Analīzē ir uzsvērts arī sašaurinājuma efekts, jo COVID-19 pandēmijas laikā, sakrītot ar plaši izplatītiem sociālās distancēšanās pasākumiem un ierobežojumiem, samazinājās A tipa streptokoku infekciju skaits. Taču pēc šī perioda M1UK strauji izplatījās Apvienotajā Karalistē, 2022. gadā ievērojami palielinoties skarlatīnas un invazīvo A tipa streptokoku infekciju skaitam.

Pēc pētnieku domām, lai gan samazināta A tipa streptokoku pārnešana pandēmijas laikā, iespējams, izraisīja novājinātu imunitāti populācijā, viņu darbs izceļ M1UK ģenētiskās iezīmes, kas norāda uz izdzīvošanas priekšrocībām salīdzinājumā ar citiem celmiem, ļaujot tam vieglāk izplatīties un potenciāli izraisīt smagāku slimību. Iespējams, ka paaugstināta populācijas imunitāte pret M1UK celmu varētu ļaut parādīties citiem celmu veidiem.

Profesors Sriskandans, kurš ir arī Baktēriju rezistences bioloģijas centra klīniskais direktors, piebilda: “Lai gan mēs tagad zinām, ka M1UK variants bija atbildīgs par ievērojamo saslimstības gadījumu skaita pieaugumu pagājušajā ziemā, tas notika neparastā gada laikā, sakrītot ar elpceļu vīrusiem un ziemas stresu, kas viss ietekmēja slimības smagumu. Galu galā saslimstības pieaugums, ko mēs novērojam dažādos laikos visā pasaulē, visticamāk, ir saistīts ar samazinātu imunitāti pret noteiktiem elpceļu patogēniem, īpaši A streptokoku. Vakcīnas varētu palīdzēt to novērst, un mums patiešām ir nepieciešama vakcīna pret A streptokoku. Šie jaunākie mūsu pētījuma atklājumi ir bijuši iespējami, pateicoties ciešai sadarbībai starp infekcijas slimību pētniekiem Imperiālajā koledžā un Apvienotās Karalistes Veselības aizsardzības aģentūras pasaulē vadošo molekulārās uzraudzības sistēmu.”