Zinātnieki ir atklājuši potenciālo mērķi nākotnes HIV vakcīnai.

Cilvēka imūndeficīta vīruss 30 gadus ir spējis izvairīties no vakcīnu ražotājiem, daļēji pateicoties tā neticamajai spējai mutēt, ļaujot tam viegli apiet jebkādus iepriekš noteiktus šķēršļus.

Taču tagad, šķiet, Masačūsetsas Tehnoloģiju institūta un Reagon institūta (abas atrodas ASV) zinātniekiem ir izdevies atrast daudzsološu stratēģiju nākotnes vakcīnas izstrādei, kurā tiek izmantota matemātiska pieeja, kas ir veiksmīgi pārbaudīta kvantu fizikas problēmu risināšanā, kā arī akciju tirgus cenu svārstību analīzē.

Vakcīnas iemāca imūnsistēmai nekavējoties reaģēt uz specifiskām patogēnu molekulārajām iezīmēm. Taču cilvēka imūndeficīta vīrusa (HIV) spēja mutēt padara praktiski neiespējamu pareizās vakcīnas izvēli. Meklējot jaunu stratēģiju, zinātnieki nolēma atteikties no atsevišķu aminoskābju mērķēšanas. Tā vietā viņi nolēma identificēt neatkarīgi evolūcijas ceļā esošas aminoskābju grupas olbaltumvielās, kur katrā grupā aminoskābes attīstās tandēmā, tas ir, "skatās viena uz otru", lai saglabātu vīrusa dzīvotspēju. Pētnieki bija īpaši neatlaidīgi, meklējot šādas grupas, kuru ietvaros notiekošajām evolūcijām būtu vislielākā iespēja beigties ar HIV sabrukumu – tā tālāku dzīvotnespēju. Pēc tam, veicot daudzpusīgu uzbrukumu tieši šādām vīrusa vietām, būtu iespējams to iesprostot "starp divām ugunīm": vai nu to nožņaugtu imūnsistēma, vai arī tas mutētu un pašiznīcinos.

Izmantojot nejaušo matricu teoriju, komanda meklēja evolūcijas ierobežojumus tā sauktajā HIV Gag proteīna segmentā, kas veido vīrusa proteīna apvalku. Viņiem bija jāatrod kolektīvi evolucionējošas aminoskābju grupas ar augstu negatīvo korelāciju līmeni (un zemu pozitīvo korelāciju skaitu, kas ļauj vīrusam izdzīvot), kad vairākas mutācijas iznīcina vīrusu. Un šādas kombinācijas tika atrastas reģionā, ko paši pētnieki nosauca par Gag 3. sektoru. Tas ir iesaistīts vīrusa proteīna apvalka stabilizēšanā, tāpēc vairākas mutācijas šajā vietā ir saistītas ar vīrusa struktūras sabrukšanu.

Interesanti, ka, pētot HIV inficētu cilvēku gadījumus, kuri dabiski spēja cīnīties pret vīrusu, viņi atklāja, ka šo pacientu imūnsistēma galvenokārt uzbruka Gag 3. segmentam.

Autori tagad cenšas atrast citus līdzīgus vīrusa struktūras reģionus ārpus Gag sektora, kā arī izstrādā nākotnes vakcīnas aktīvo komponentu elementus, kas iemācīs imūnsistēmai nekavējoties reaģēt uz Gag 3. sektora olbaltumvielu klātbūtni un nekavējoties uzbrukt tai pareizajā veidā.

Nākamā ir testēšana ar dzīvniekiem, bet pagaidām visa darba informācija tiks prezentēta Biofizikas biedrības 56. ikgadējā konferencē, kas notiks no 25. līdz 29. februārim Sandjego, Kalifornijā, ASV. Prezentācijas kopsavilkums ir pieejams šajā saitē.

[ 1 ], [ 2 ], [ 3 ], [ 4 ], [ 5 ], [ 6 ], [ 7 ], [ 8 ]