Pētījums: gēni ietekmē augļu un šķiedrvielu pretvēža iedarbību

Nesen žurnālā eBioMedicine publicētā pētījumā ir identificētas ģenētiskas variācijas, kas var mainīt saistību starp šķiedrvielu, augļu un dārzeņu uzņemšanu un kolorektālā vēža (KRV) risku. Pētniekiem veiksmīgi izdevās identificēt divus nozīmīgus lokusus, kas maina saistību starp šķiedrvielu un augļu uzņemšanu un KRV risku.

KRV ir viens no visizplatītākajiem vēža veidiem pasaulē, 2020. gadā reģistrējot gandrīz divus miljonus jaunu saslimšanas gadījumu un vairāk nekā 900 000 nāves gadījumu. Ir ziņots, ka liels augļu, dārzeņu, pilngraudu un šķiedrvielu patēriņš samazina KRV risku. Lai gan pastāv spēcīgi pierādījumi par saistību starp KRV risku un pilngraudu un šķiedrvielu uzņemšanu, pierādījumi par saistību starp KRV risku un augļu un dārzeņu uzņemšanu joprojām ir ierobežoti.

Iepriekšējie genoma mēroga asociācijas pētījumi (GWAS) ir identificējuši vismaz 200 lokusus, kas saistīti ar KRV risku, izskaidrojot līdz pat 35% no iedzimtības. Lai gan gēnu un vides (G × E) mijiedarbība var izskaidrot papildu iedzimtību, iepriekšējie pētījumi ar nelielām izlasēm un tradicionālajām metodēm ir atklājuši tikai ierobežotu skaitu nozīmīgu mijiedarbību. Jaunām statistiskajām pieejām, piemēram, konjunktīvas testiem un divpakāpju metodēm, kas piešķir prioritāti viena nukleotīda polimorfismiem (SNP), ir potenciāls uzlabot šo analīžu precizitāti.

Analīzē tika iekļauti līdz pat 45 pētījumi no trim KRV ģenētiskajiem konsorcijiem, tostarp Eiropas izcelsmes indivīdi. Pētījumos bija iekļautas gadījumu kontroles kopas kohortas pētījumiem un vēža neskartas kontroles kopas gadījumu kontroles pētījumiem. Kopumā tika analizēta attiecīgi 69 599, 69 734 un 44 890 dalībnieku augļu, dārzeņu un šķiedrvielu uzņemšana. Uztura uzņemšana tika novērtēta, izmantojot pārtikas biežuma anketas un uztura vēstures, parasti izsakot kā porcijas dienā augļiem un dārzeņiem un gramus dienā kopējam šķiedrvielu daudzumam.

Dati tika saskaņoti un izteikti kā kvartiles vērtības pēc dzimuma un pētījuma. Turklāt genotipa noteikšanas kvalitātes kontrole ietvēra trūkstošo datu, Hārdija-Veinberga līdzsvara un dzimumu nesakritības pārbaudi, kam sekoja imputācija un filtrēšana, lai noteiktu mazāk izplatītu alēļu biežumu un precizitāti, kā rezultātā tika analizēti 7 250 911 SNP.

Salīdzinot ar kontroles grupu, dalībnieki ar KRV bija vecāki, viņiem bija augstāks ķermeņa masas indekss un enerģijas uzņemšana, kā arī lielāka tādu riska faktoru izplatība kā KRV ģimenes anamnēze un 2. tipa diabēts. Viņi arī patērēja mazāk šķiedrvielu, augļu un dārzeņu salīdzinājumā ar kontroles grupu. Metaanalīzēs tika konstatēta apgriezta saistība starp šķiedrvielu (relatīvais risks uz kvartili (OR) = 0,79), augļu (OR = 0,79) un dārzeņu (OR = 0,82) uzņemšanu un KRV risku.

3-DF tests identificēja rs4730274 lokusu augšpus SLC26A3 gēna, kas parāda saistību ar šķiedrvielu uzņemšanu un mijiedarbību ar KRV risku. Stratifikācija pēc genotipa uzrādīja spēcīgāku apgrieztu saistību starp šķiedrvielām un KRV katrai T alēles kopijai. Funkcionālā anotācija liecināja par pastiprinātāja aktivitāti resnās zarnas audos, ar eQTL DLD gēnam.

Lokuss rs1620977 NEGR1 gēna tuvumā uzrādīja būtisku saistību ar augļu patēriņu un mērenu mijiedarbību ar KRV risku. Spēcīgas apgrieztas saistības tika novērotas, palielinoties augļu patēriņam katrai G alēles kopijai.

Šis ir līdz šim lielākais G×E pētījums, kurā pētnieki identificēja divas mijiedarbības starp šķiedrvielām, augļu uzņemšanu un KRV risku. Konkrēti, rs4730274 SLC26A3 gēna tuvumā liecina par būtisku saistību starp šķiedrvielu uzņemšanu, zarnu darbību, iekaisumu un KRV. Rezultāti prasa veikt turpmākus pētījumus, lai pārbaudītu klīniskās sekas un apstiprinātu šos atklājumus dažādās populācijās.