Bipolāru afektīvu traucējumu ārstēšanu galvenokārt veic ar normotimiskiem līdzekļiem ("afekta stabilizatoriem"), piemēram, litiju, karbamazepīnu vai valproīnskābi. Bet dažreiz viņi izmanto arī relatīvi jaunas zāles: olanzapīnu, risperidonu, lamotrigīnu, gabapentīnu, kalcija antagonistus.