Pētījumā identificētas baktērijas, kas saistītas ar priekšlaicīgām dzemdībām

Ziemeļkarolīnas štata universitātes pētnieki ir atklājuši, ka vienā maksts mikrobiomā var pastāvēt vairākas Gardnerella sugas, baktērijas, kas dažkārt ir saistītas ar bakteriālo vaginozi (BV) un priekšlaicīgām dzemdībām.Žurnālā mSystems publicētie atklājumi veicina arvien lielāku izpratni par Gardnerella ietekmi uz cilvēku veselību.

Gardnerella ir anaerobo baktēriju grupa, kas bieži sastopama maksts mikrobiomā. Paaugstināts šo baktēriju līmenis ir BV pazīme un ir saistīts ar paaugstinātu priekšlaicīgu dzemdību risku, taču tās ir sastopamas arī sievietēm bez slimības pazīmēm.

"Mēs centāmies izprast Gardnerella daudzveidību," saka Bens Kallahans, Ziemeļkarolīnas štata universitātes iedzīvotāju veselības un patobioloģijas asociētais profesors un raksta līdzautors.

"Zinātnieki tikai nesen ir sākuši pētīt atsevišķas Gardnerella sugas, tāpēc mēs vēl nezinām, vai dažādām sugām varētu būt atšķirīga ietekme uz veselību. Mūsu galvenais mērķis bija pētīt Gardnerella ekoloģiju."

Unikāls maksts mikrobioma sekvencēšanas izaicinājums ir tas, ka jebkurš paraugs galvenokārt sastāv no saimnieka DNS, padarot mikrobu datu iegūšanu dārgāku un darbietilpīgāku. Pētnieku komandas pirmais uzdevums bija izstrādāt metodoloģiju, kas ļautu identificēt dažādas Gardnerella sugas no mikrobioma datiem.

"Pieejamie rīki vaginālā mikrobioma izpētei visus Gardnerella ģints pārstāvjus uzskata par vienu sugu," sacīja Hanna Bermane, Ziemeļkarolīnas štata universitātes pēcdotorantūras pētniece un raksta galvenā autore. "Lai veiktu šo darbu, mums bija jāizveido sava Gardnerella genomu datubāze un jāizstrādā metode dažādu Gardnerella sugu identificēšanai. Cerams, ka tas arī ļaus vairāk pētniekiem pētīt Gardnerella ģints daudzveidību."

Pētnieku komanda pārbaudīja sekvencēšanas datus no trim kohortām: divām nejauši izvēlētām grūtnieču populācijām un vienas populācijas ar priekšlaicīgu dzemdību anamnēzi. Viņi analizēja Gardnerella metagenomiskās sekvences no paraugiem, lai noskaidrotu, vai pastāv saistība starp konkrētām Gardnerella sugām un priekšlaicīgām dzemdībām.

Lai gan viņi neatrada "apstiprinošo pierādījumu", viņi tomēr atklāja divus pārsteidzošus faktus.

Vispirms viņi identificēja potenciālu 14. Gardnerella sugu starp paraugiem — pirms šī darba bija identificētas tikai 13 sugas.

Viņi arī atklāja, ka vairumā paraugu, kas saturēja Gardnerella, vienā mikrobiomā pastāvēja vairākas Gardnerella sugas: atsevišķos paraugos tika atrastas no divām līdz visām 14 zināmajām Gardnerella sugām.

"Parasti, ja baktēriju suga kolonizē vidi, mēs sagaidām, ka tā izslēgs tuvus radiniekus, kas ieņem to pašu ekoloģisko nišu un patērē tos pašus resursus," saka Kalahans. "Es bieži saku, ka ar baktērijām viss ir iespējams, taču tas joprojām ir neparasti. Mēs arī redzējām, ka, ja kopējā mikrobu slodze ir lielāka, Gardnerella veido lielāku šīs slodzes daļu."

"Pierādījumi turpina uzkrāties, ka Gardnerella ir saistīta ar priekšlaicīgām dzemdībām, taču šīs attiecības detaļas ir sarežģītas. Šajā darbā mēs neatradām vienu kaitīgu Gardnerella sugu — iespējams, tās visas ir kaitīgas. Tas vēl nebūt nav stāsta beigas."

Pētnieki cer turpināt pētīt sugu līdzāspastāvēšanas un mikrobioma sastāva jautājumus.

"Maksts mikrobioms tiek nepietiekami novērtēts," saka Kalahans. "Piemēram, tajā bieži dominē viena Lactobacillus suga, kas rada vidi, kurā neiekļūst citas baktērijas. Kad tā ir pazudusi, ir Gardnerella. Tātad, kā šīs baktērijas mijiedarbojas?"

"Atbildes uz šiem jautājumiem varētu novest pie efektīvākas BV ārstēšanas un veidiem, kā paredzēt un novērst priekšlaicīgas dzemdības. Šis darbs ir svarīgs solis šajā procesā."